L'heure est grave, un déséquilibré s'amuse depuis quelque temps à tirer des roquettes contre des civils innocents. Les Nations Unies décident de contre-attaquer en envoyant leur arme ultime, un Hovercraft. Surgical Strike sur Mega CD est un jeu d'action vous mettant aux commandes de cet engin de guerre dernier cri pour réduire la menace terroriste à néant.